Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG7P83436 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG7P83436 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG7P83436 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG7P83436 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG7P83436 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG7P83436 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG7P83436 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG7P83436 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG7P83436 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG7P83436 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG7P83436 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms