Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms