Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITPNBP48739 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms