Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms