Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB8P17481 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB8P17481 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB8P17481 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB8P17481 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB8P17481 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms