Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM6P0DI80 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM6P0DI80 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms