Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC3P02656 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC3P02656 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC3P02656 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC3P02656 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC3P02656 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC3P02656 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC3P02656 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms