Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN3O60637 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN3O60637 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN3O60637 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms