Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms