Protein–RNA interactions for Protein: O43390

HNRNPR, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPRO43390 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPRO43390 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HNRNPRO43390 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPRO43390 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPRO43390 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPRO43390 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPRO43390 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPRO43390 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms