Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VILLO15195 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VILLO15195 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VILLO15195 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VILLO15195 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VILLO15195 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VILLO15195 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VILLO15195 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VILLO15195 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VILLO15195 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VILLO15195 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms