Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf118A6NHY6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms