Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DYNLL1P2-201ENST00000554807 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CLEC4C-205ENST00000542353 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL035250.2-201ENST00000440889 620 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RN7SL553P-201ENST00000482215 298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 IFITM9P-201ENST00000535743 396 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDH10Q9P2E7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms