Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTF1AQ7RTS3 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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