Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTGS1P23219 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTGS1P23219 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms