Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms