Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 MIA-201ENST00000263369 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 AP003692.1-201ENST00000521706 796 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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