Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASP4P49662 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASP4P49662 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASP4P49662 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CASP4P49662 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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