Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX2IPQ9Y2D8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms