Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHA4Q9UN74 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA4Q9UN74 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms