Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSKSQ9UJT2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSKSQ9UJT2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms