Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPASTQ9UBP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms