Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM30AQ9NV96 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms