Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD248Q9HCU0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD248Q9HCU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms