Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 MYO5C-207ENST00000559459 2129 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 GPC1-204ENST00000426280 636 ntTSL 311.91□□□□□ -0.53e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 MYO5C-205ENST00000558902 3074 ntTSL 211.88□□□□□ -0.513e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.563e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-212ENST00000522873 613 ntTSL 311.51□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 UBTF-211ENST00000530828 721 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 COMMD10-204ENST00000507356 870 ntTSL 311.23□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-210ENST00000522285 393 ntTSL 39.83□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 MYO5C-209ENST00000560809 6076 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-203ENST00000518298 921 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.093e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.373e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 DCBLD1-210ENST00000533453 3584 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.453e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 COMMD10-203ENST00000506589 793 ntTSL 55.33□□□□□ -1.563e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 HS1BP3-206ENST00000446825 841 ntTSL 313.82□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.298e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 518.79■□□□□ 0.68e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.177e-9■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 521.31■■□□□ 15e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TOLLIP-213ENST00000532551 576 ntTSL 211.72□□□□□ -0.535e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-203ENST00000501869 684 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-205ENST00000504769 548 ntTSL 415.28■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-206ENST00000504922 585 ntTSL 214.39□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-210ENST00000510087 590 ntTSL 313.5□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 37.12□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 35.55□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 MED16-208ENST00000592373 927 ntTSL 316.86■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.64e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.324e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.14e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.954e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.924e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FGD6-202ENST00000451107 2232 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SH3GL1-205ENST00000598230 577 ntTSL 517.49■□□□□ 0.394e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 517.24■□□□□ 0.354e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 DOLPP1-201ENST00000327812 1932 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 NUP133-202ENST00000366678 779 ntTSL 516.2■□□□□ 0.184e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CRTC2-206ENST00000476883 467 ntTSL 515.7■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.049e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.049e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-208ENST00000409627 722 ntTSL 315.28■□□□□ 0.049e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 DOLPP1-204ENST00000412363 911 ntTSL 515.23■□□□□ 0.034e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 513.8□□□□□ -0.27e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.29e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SDCCAG8-210ENST00000496361 947 ntTSL 213.73□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.239e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.239e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CREBBP-205ENST00000571826 627 ntTSL 213.42□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CREBBP-206ENST00000572134 846 ntTSL 513.41□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SH3GL1-203ENST00000593591 1036 ntTSL 413.34□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-204ENST00000481385 2787 ntTSL 212.77□□□□□ -0.374e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 412.4□□□□□ -0.427e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.489e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-212ENST00000515594 3074 ntTSL 211.98□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.599e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-210ENST00000453383 590 ntTSL 411.22□□□□□ -0.614e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-205ENST00000494284 2854 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-202ENST00000412557 506 ntTSL 310.74□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 510.37□□□□□ -0.757e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 NLRP1-213ENST00000576905 555 ntTSL 410.14□□□□□ -0.794e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 NLRP1-209ENST00000572143 578 ntTSL 410.07□□□□□ -0.84e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.834e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 59.39□□□□□ -0.917e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CREBBP-203ENST00000570939 3316 ntTSL 59□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FGD6-204ENST00000548069 725 ntTSL 38.83□□□□□ -14e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-208ENST00000506783 3700 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -14e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SDCCAG8-205ENST00000476722 1871 ntTSL 38.75□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 CRTC2-208ENST00000492073 329 ntTSL 58.29□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SDCCAG8-206ENST00000482234 549 ntTSL 37.35□□□□□ -1.234e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.239e-11■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.94e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.678e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 513.67□□□□□ -0.225e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 FADS2-206ENST00000518606 510 ntTSL 46.75□□□□□ -1.335e-7■■■■□ 24.6
CSTF2TQ9H0L4 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 24.6
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 166 ms