Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC2Q9BYS8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC2Q9BYS8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms