Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms