Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RETNLBQ9BQ08 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms