Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.6 ms