Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms