Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG4CQ96DT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4CQ96DT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms