Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG3Q8WXD2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms