Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN12Q8IYM2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms