Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRCAPQ6ZRS2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms