Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMV7

LEKR1, Leucine-, glutamate- and lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEKR1Q6ZMV7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LEKR1Q6ZMV7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEKR1Q6ZMV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms