Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP26C1Q6V0L0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP26C1Q6V0L0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms