Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LARP1Q6PKG0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms