Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPANXN3Q5MJ09 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPANXN3Q5MJ09 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms