Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EFHC2Q5JST6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC2Q5JST6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC2Q5JST6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms