Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3BQ502W6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VWA3BQ502W6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWA3BQ502W6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms