Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
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NCOA1Q15788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
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NCOA1Q15788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
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NCOA1Q15788 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
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NCOA1Q15788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
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NCOA1Q15788 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA1Q15788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
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