Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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SETDB1Q15047 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETDB1Q15047 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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