Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERV3-1Q14264 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERV3-1Q14264 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms