Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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