Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE7AQ13946 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE7AQ13946 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE7AQ13946 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE7AQ13946 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE7AQ13946 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE7AQ13946 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDE7AQ13946 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE7AQ13946 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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