Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF543Q08ER8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms