Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCL1Q07820 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCL1Q07820 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms