Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF11Q05519 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF11Q05519 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF11Q05519 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF11Q05519 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF11Q05519 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF11Q05519 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF11Q05519 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF11Q05519 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF11Q05519 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRSF11Q05519 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF11Q05519 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF11Q05519 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRSF11Q05519 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms