Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELAQ04206 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELAQ04206 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELAQ04206 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELAQ04206 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms