Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms